我国水产养殖业中使用的消毒剂有很多种类，而比较常见和用量比较大的消毒剂就是氯制剂，如漂白粉、三氯异氰尿酸等，但是氯制剂杀灭微生物效果易受到水体中各种环境因子的影响，容易丧失其有效成分。水体的PH值也会对灭杀效果造成影响，另外氯制剂对养殖水生动物的刺激性也比较大。

二氧化氯作为第四代消毒剂，被联合国卫生组织认定为A1级消毒剂，用纯二氧化氯作为水产养殖用消毒剂具有以下好处：

一、采用纯二氧化氯消毒，可以避免消毒后水体中出现三卤甲烷之类的有害物质。用常规的氯制剂进行消杀，易产生大量的消毒副产物，如三卤甲烷等，三卤甲烷会作用于动物的中枢神经，造成动物的肝脏、肾脏损伤，对动物的健康危害很大。

二、将纯二氧化氯作为消毒剂，因为消毒过程是氧化反应而非氯化反应。所以，水体中即使存在有机物质，采用纯二氧化氯消毒后也不会有THMs等物质的生成。

三、二氧化氯消毒剂的消毒杀菌效率较氯制剂高。二氧化氯消毒杀菌效果明显优于漂白粉、三氯异氰尿酸，不仅可以达到比较好的消毒效果，还可以减轻行消毒操作人员的进劳动强度。

四、纯二氧化氯具有瞬间消毒的特征，也就是这类消毒剂能在短时间内完成消毒，其消毒能力的消失速度也较其他消毒剂迅速。二氧化氯的这种特性，尤其适合将其作为水产养殖的消毒剂。在养殖水体中进行消毒时，如果消毒剂将水体环境中的细菌彻底灭杀后，反而会引起水体缺氧等一系列不利的严重后果，如果消毒剂本身的灭菌能力不能尽快消退，水体中的正常微生态环境就难以在短时间内得到恢复，结果实惠直接影响到水产养殖生产的经济效益的。