二氧化氯作为强氧化剂，具有较高的氧化还原电势，和氯气以亲电取代为主不同，是以氧化反应为主，有机物被氧化后降解为氧基因产物存在，不以三氯甲烷等卤代烃有害物质形式存在，且二氧化氯较氯气更适用于更宽的PH值范围，所以就反应机理而言，二氧化氯较氯气具有更好的除藻、除腥效果，并能有效地控制卤代烃的生成量。

由于纯二氧化氯在原水预处理中的效果好，因此选择好的二氧化氯发生器很关键，一般的高纯二氧化氯发生器 设备较贵，原料价格昂贵，且运输、保管方面难度较高，所以对于二氧化氯发生器的原料转化率、稳定性已经性价比等方面需要综合考量。在实际应用过程中，还需要注意二氧化氯投加量的控制和投加点的选择。