二氧化氯发生器需要注意的安全问题主要包括设备自身的安全性、原料的安全存放以及设备的正确操作三个方面。
对于设备厂家来说，最重要的是设备自身的安全性即安全设计。由于二氧化氯性质不稳定，必须现场发生反应，因此二氧化氯发生器在设计系统时必须预防二氧化氯气体的积累导致的泄漏。
除此之外，厂家在设计二氧化氯发生器反应系统时，还需要充分考虑到多种意外事故（如停电、停水、过压、过热等等），例如：增加一个停水时能够自动关掉反应系统的设计（至少保证原料不再继续投加的装置），遇到突发状况，能自动切断二氧化氯发生途径，通过增加此类设计，以保证发生类似情况时，有效解决二氧化氯浓度积累的问题，只有这样才能彻底解决二氧化氯发生器可能存在的安全隐患。
